乳腺癌是一种异质性疾病, 是全球女性癌症死亡的主要原因, 但目前临床对乳腺癌精准医疗的主要障碍是我们对乳腺癌生态系统缺乏了解。肿瘤细胞和相关的健康细胞的形成决定疾病进展和治疗反应的生态系统。
为了表征乳腺癌生态系统的特征及其与临床数据的关联，苏黎世大学分子生命科学研究所的Johanna Wagner教授带领的研究团队利用质谱仪分析了144例人类乳腺肿瘤和50例非肿瘤组织样本，检测了2600万个细胞中73种蛋白的表达。研究发现不同乳腺癌患者肿瘤微生态系统存在明显差异，这些差异与相应肿瘤患者预后显著相关。该研究或为乳腺癌临床精准治疗提供更优方案。相关研究发表在《Cell》上。
肿瘤生态系统
肿瘤生态系统由癌细胞、浸润性免疫细胞、基质细胞和其他细胞类型以及非细胞组织成分组成。由于遗传和非遗传来源，癌细胞和其它肿瘤相关细胞在表型上和功能上是异质的。肿瘤生态系统进一步受细胞关系的影响。
患者分类和治疗应该理想地考虑整个肿瘤生态系统。最近的单细胞RNA测序研究揭示乳腺癌免疫细胞表型多样性和生态系统的冰山一角，为使用大型患者队列研究奠定基础。然而，目前基于标志物的分层筛查决策尽管改善了治疗成功率，但患者的反应在每个亚型内都有所不同，需要更好地表征乳腺癌生态系统。
单细胞质谱流式
研究人员利用单细胞质量流式细胞仪对来自覆盖所有临床亚型的144个人乳腺肿瘤样本中的数百万个细胞进行检测，并引入描述肿瘤表型异常、个性和丰度的计算分数。结果肿瘤和免疫生态系统中的肿瘤分层模式，不依赖于亚型和分级。因此，应该考虑评估整个癌症生态系统，针对肿瘤及其免疫环境为免疫疗法临床试验患者设计精确疗法。
价值展望
为了提高乳腺癌精准治疗的成功率，需要新的治疗方法。首先是全面描述肿瘤生态系统复杂的细胞和表型多样性，以及肿瘤生态系统各组成部分之间的关系。该研究为我们提供了一个乳腺癌生态系统的地图集，为今后的研究提供有价值的参考，确定临床相关的细胞表型和肿瘤生态系统中的关系，为患者分层和精准医学应用提供参考。
