近年来，合肥市生物医药产业规模稳步攀升，形成了高新区、经开区和巢湖经开区三大产业集聚基地，产业布局更加合理，各类创新要素加速集聚，正朝着集聚化和规模化发展。
一、产业规模
合肥市生物医药产业规模保持高速增长，2017年合肥市规上医药制造业主营业务收入突破500亿元，近四年在波动中保持增长态势。2017年，合肥市生物产业总产值约350亿元，复合增长率16%，位居安徽省前列。
二、空间链
目前，合肥市形成了以高新技术开发区（以下简称“高新区”）、经济技术开发区（以下简称“经开区”）和巢湖经济技术开发区三大产业集群为核心的生物医药产业空间格局。
1.合肥高新区
合肥高新区生物医药和高端医疗器械产业集聚发展基地，作为安徽省战略性新兴产业集聚发展基地之一，生物医药产业基础雄厚、优势明显。目前，高新区已集聚健康医疗企业超过400家，形成了以安科生物、立方制药、兆科药业、美亚光电等龙头企业为引领，以欣睿生物、中盛溯源、中科普瑞昇、金域检测等新兴企业为重点，以离子医学中心、新星医药、医工医药等研发机构为创新支撑，覆盖技术研发、生产制造、商业流通、医疗诊治、健康服务全流程的产业链。2017年，合肥高新区生物医药产业实现产值120多亿元。
作为国家健康医疗大数据中部中心建设承载区，合肥高新区充分发挥园区健康医疗与大数据产业叠加发展优势，2019年1月，吸引了涵盖生物药、高端化药、基因检测、医疗器械、技术平台等多个细分类别，总投资125亿元的30个健康医疗大数据项目落地，其中生物医药项目10个，高端化药项目6个，数据医疗项目4个，基因检测项目3个，技术平台项目2个，医疗器械项目2个，总部基地项目2个，现代中药项目1个。2017年，合肥市与中国科学院广州生物医药与健康研究院合作，成立了合肥干细胞与再生医学研究院，园区选址高新区生物医药产业园，一期项目占地243亩，规划建筑面积约28万平方米，建设内容包括研发办公、中试厂房、总部办公基地、成果转化演示中心、人才公寓、会务中心等综合服务设施。
2.合肥经开区
合肥经开区以宿松路沿线为核心逐渐发展，拥有天麦生物、尼普洛、大桐制药、中国医药、安徽省医药等一批知名企业，形成医药流通和医药、医疗器械生产两大版块。医药健康产业园已集聚59家医药物流和生产企业，成为全省最大、全国知名的医药物流园区。医疗器械生产企业尼普洛生产的透析器技术全球领先，在中国市场占有率约40%。医药生产企业天麦生物历经多年孵化、研发，形成全系列胰岛素针剂产品链，即将进入产业发展爆发期。合肥经开区依托中国科大安徽省医药生物技术工程研究中心、安徽医科大学等高校科研机构科研力量，将努力打造全球首个口服胰岛素胶囊基地，全国重要的生物医药及高端医疗器械产业基地。
2016年经开区规模以上医药生产企业实现产值3.5亿，同比增长67%；医药流通（批发、零售）企业实现营业额105亿；医药生产、流通企业2016年累计税收3.45亿元，同比增长43.8%。
3.合肥巢湖经济开发区
合肥巢湖经济开发区打造合肥半汤生物经济实验区，打造生物经济孵化器、生物经济社区和国际健康中心。生物经济孵化器主要项目有：抗体中心、研发中心、交流中心、生物金融小镇、实验动物中心和未名生物经济学院；生物经济社区主要项目包括：未名公社、半汤部落和养老社区；国际健康中心主要项目有：健康物联网中心、健康服务中心、健康体检中心、干细胞中心、CART细胞治疗中心和未名国际医院。
三、产业链
目前合肥拥有2家A股（含创业板）生物医药领域上市公司，5家新三板上市公司，已形成以安科生物、智飞龙科马、北大未名、悦康药业等为代表的生物药企业集群；以立方制药、兆科药业、贝克药业等为代表的化学药企业集群；以华威药业、威尔曼制药、合恩医药为代表的现代中药企业集群；以欧普康视、美亚光电、华米科技等为代表的高端医疗器械企业集群。同时，集聚了影联乐金、紫薇帝星数字科技等智慧医疗创新型企业，以及中科美菱等特色化冷链物流企业。
四、创新链
1.创新平台加速集聚。合肥市拥有中国科学技术大学、合肥工业大学等国内知名综合性院校，拥有安徽医科大学和安徽中医药大学两所专业本科院校，依托三大产业集聚基地，集聚了中国科大安徽省医药生物技术工程研究中心、合肥干细胞与再生医学研究院等科研机构科研力量。依托安科生物等行业龙头企业建设基因工程制药安徽省重点实验室；依托安徽医科大学等高校资源，共建工程技术研究中心和产业化技术研究院，如抗炎免疫药物安徽省工程技术研究中心和安徽省创新药物研究院。
2.创新成果突出。根据火石创造数据库数据显示，截止目前，合肥市累计获批国产药品1007件，其中包括化药764件，生物制品51件，中药185件。累计获批国产医疗器械1409件，其中包括一类医疗器械187件，二类医疗器械1160件，三类医疗器械59件。
3.创新资本有待加强。2017年，合肥生物医药产业累计发生融资事件3起，涉及医疗器械、药品和医疗服务。2018年，合肥市生物医药产业累计发生融资事件4起，主要涉及医疗信息系统、智能影像识别等智慧医疗领域。
4.创新人才：产业领军人才不断集聚。近年来，合肥的人才吸引力稳步提升，如合肥科学岛引入“哈佛八剑客”，致力于新药研发。通过引入巴特恩（BUTTON）基金，与海外149家机构及团体建立了合作关系，其中包括13所美国顶级大学医学院，如约翰霍普金斯大学、斯坦福大学，以及强生、美敦力等25家医疗行业跨国公司。
