生命体的遗传稳定性在于基因组,功能多样性在于蛋白质组。蛋白质组是由若干蛋白质所构成的集合体,其构成原则即其丰度整体分布规律是科学界长期研究的重大理论问题。中国军事医学科学院放射与辐射医学研究所、北京蛋白质组研究中心、蛋白质组学国家重点实验室及复旦大学生物医学研究院在贺福初院士的领导下,在多物种间揭示了蛋白质丰度的整体分布,且蛋白质的进化、结构和功能存在规律性的相关,《科学公共图书馆—综合》日前在线发表了有关研究成果。
研究人员选取了生命进化史中具有代表性的大肠杆菌、酵母、线虫、果蝇、小鼠、人等6个物种为研究对象,综合它们的定量蛋白质组数据后发现,在进化上蛋白质丰度与其起源时间和序列保守性呈正相关;从结构角度而言,蛋白质丰度与其结构域数目呈负相关,而与其结构域的覆盖度呈正相关;蛋白质的功能决定其丰度。蛋白质丰度分布规律的揭示对于深入认识生命体的蛋白质构成原则具有重要意义,同时也为从海量数据到知识归纳提供了有效的实践模式。该研究也是荟萃分析(meta-analysis)和深度挖掘方法系统应用于蛋白组学数据的一个成功范例,为今后更加合理有效地利用组学数据进行理论生物学研究提供了方法和思路。(中国科学报)