2018年7月初，中国遗传病精准诊断技术的代表性公司——智因东方（原德易东方）发布了全球首家第三方遗传病精准诊断技术服务的加急模式，可将原先1~3个月的基因检测分析的漫长周期压缩到6~10天，极限情况可以在6天内完成。
遗传病种类繁多，疾病之间表型重叠，容易混淆，常规诊断很难，故常被称为“疑难杂症”。随着近年来高通量测序（NGS，Next-generation sequencing）技术的应用，疑难遗传病诊断的难度有所降低了，但检测和分析周期往往长达1~3个月，仍然难以满足实际临床需求。本次智因东方推出的加急模式，将有助于帮助医生大幅缩短遗传病诊断周期。
智因东方的加急模式的特点是：
检测范围全面
智因加急模式颠覆了传统诊断的试错模式，采用至少基于患者及其父母等家系成员在内的全外显子组测序（trioWES），还可以包括全家系的拷贝数变异检测（trioCNVseq），甚至包括全家系的非编码区测序等检测策略，一步到位，全面覆盖，避免应用panel反复试错带来的费用高、周期长等弊端。以下是关于这个检测策略设计相关的几个要点：
1. 为何要检测全外显子而非Panel或临床外显子？
因为人类每年都能新发现几百种遗传病，应用Panel或临床外显子（Clinical Exome，也称“医学外显子”）很可能因检测范围不全而存在漏检，另一方面检测全外显子（WES）能给患者提供阴性结果的回顾性分析的机会，而Panel及临床外显子则不能。在检测价格相差不大甚至倒挂的情况下，选择全外显子更能体现“Patient First”理念。
2. 为何要用trio模式（先证者+父母的核心家系成员均做高通量测序）？
因为trio模式可以一步到位判断基因变异是否符合遗传学共分离原则，从而在诊断速度上远超先证者模式（仅检测先证者，再用一代测序验证父母）。
3. 为何要检测CNVseq？
因为有10-20%的疾病是由大片段（>500k）的拷贝数变异（CNV, Copy Number Variations）而来，有些致病区域未必在外显子范围，所以CNVseq以其检测范围全面（全基因组）和数据高度均衡（省略了全外显子等捕获测序的PCR过程带来的拷贝数失真）而独具优势。
4. 为何要检测已知疾病的非编码区？
因为这部分的变异是全外显子测序所不包括的，但有可能与疾病发生相关。
变异形式全面
不仅检测范围全面，为避免漏检，智因加急模式还可以同时涵盖检测分析小、中、大三类基因变异形式，即分别是点突变、基因内部外显子缺失重复、CNV及单亲二倍体（UPD，uniparental disomy）。
其中智因独有的全外显子分析流程，可以全面分析二万个基因内部的外显子缺失重复。
智因CNVseq不仅可以在CNV分析的准确性上不输于CMA芯片，而且结合全外显子可以精准分析UPD。
此外，智因加急模式甚至还包括针对特定疾病的整体解决方案，涵盖mtDNA测序、三碱基重复检测等。这样可以尽最大可能提高一次检出率，满足加急诊断的需求。
数据质量高
当前有越来越多的证据表明Sanger测序（或称一代测序）对于NGS检出的杂合变异和嵌合体变异，常常会给出假阴性的验证结果。
智因加急模式的全外显子测序整体测序深度高达200~300X，40~60X以上覆盖度超过99%，不仅绝大多数的杂合变异的可信度高于Sanger测序，还能检测出很多低丰度嵌合体，这也是一代测序所难以检测到的。提升NGS数据的质量和NGS结果的可信度，使得一步到位的快速诊断成为可能，而无需完全依赖于Sanger测序验证结果。
精准到位的临床诊断级数据注释
NGS数据分析是遗传病精准诊断中最费时的环节，要从WES数据中的几十万个变异中“大海捞针”般找到致病突变，在过去需要漫长的人工分析时间。
智因东方凭借其独创的遗传病三要素数据分析注释平台，可在全外显子测序检出的数十万个变异中，精准挑选出几乎唯一的致病突变，并结合临床表型给出相对贴近临床诊断的结果，整个过程可以在数分钟内全自动完成。
这一自动注释体系，不仅可以全自动给出每一个变异的ACMG致病评级，还能结合智因东方独有的万人级遗传病患者表型+全外显子组大数据，给出每一个变异分别在患者大数据中和正常人大数据中的频率，并且对于在患者中相对富集的变异，还能进一步给出携带该变异的患者群体的表型聚类信息，对变异是否致病给出“真实世界证据”。
智因平台所提供的全自动的临床诊断级数据注释，极大程度降低了人工分析的难度和时间，为进一步缩短诊断周期创造了条件。如果把遗传病精准诊断比作一场球赛，那么智因东方所实现的从NGS实验到数据临床诊断级注释的过程，就好比从后场发起进攻，直到创造了点球机会。最后一步就是由人工结合更多临床信息，配合医生做出最终诊断，完成最后的“临门一脚”。
近乎极致的高检出率
上述全面的检测范围，覆盖全面的变异形式，加上高质量的测序，精准到位的临床诊断级数据注释，最终体现为对高检出率的极致追求。
极高的性价比
对于如此庞大的检测策略（测得全），如此高的数据质量（测得深且准），如此极速的检测分析周期，通常意味着高昂的价格，但智因东方通过优化各环节效率以降低加急模式的成本，并将节省下来的成本回馈社会，提供高性价比的加急模式检测服务，力求让绝大多数患者家庭都能承担得起。
近年来国外陆续出现缩短遗传病精准诊断周期的报道，但那些案例仅限于个案报道，而非通用流程，无法满足众多患者的需求。而本次智因东方发布的加急模式则是通用流程，所有应用这一流程的患者都有可能从中获益，从而得到快速诊断的机会。
