但是，相比2015年度的榜单，北京协和医院和四川大学华西医院的总分分别下降0.123和0.53分，而中国人民解放军总医院则上升0.06分。另外，蕴含医院可持续发展能力的科研学术得分，由SCI得分和国家科学技术奖得分组成。值得注意的是，2016年度榜单纵向对比中，四川大学华西医院和中国人民解放军总医院的科研学术得分，高于北京协和医院。
稳定有序不等于一成不变
2016年，复旦大学医院管理研究所的一项调研显示，7年间全国各医院的最佳专科声誉排名相对稳定，据统计，65%-68%的专科声誉排名不会有“1位数”的变动，而“3位数”变动的仅在2%以下。因此，复旦版排行榜相对稳定，但不意味着一成不变。
权重占比20%的科研学术分，因各医院每年的科研成果、学术论文、获奖项目等不同，让复旦版医院排行榜每年的最终排名充满“悬念”。这些微妙变化和成果多寡的“敏感性”，导致全国各大医院间形成一种良性竞争格局。进一步统计也证实，医院的科研产出已呈现不进则退，少进也退的“格局”。也就是说，只有“多进”才能“排前”。
医院综合排名“第一梯队”无变化
稳定有序的另一处体现，是2016年度榜单“第一梯队”跟2015年相比“一丝没变”。 这源于排行榜专注“学科”这一评价维度，而医院学科建设并非一蹴而就。
位列中国医院排行榜（综合）前10位的分别为北京协和医院、四川大学华西医院、中国人民解放军总医院、上海交通大学医学院附属瑞金医院、空军军医大学西京医院、复旦大学附属中山医院、中山大学附属第一医院、复旦大学附属华山医院、华中科技大学同济医学院附属同济医院、北京大学第一医院。
此外，“第一梯队”与“第二梯队”的分值差距正逐步拉大，北京大学第一医院比位列第11位的华中科技大学同济医学院附属协和医院高出了4.085分。
大幅度涨幅不见 持续跃升显实力
2016年榜单的最大黑马，当属重新“杀回”前100的东方肝胆外科医院，位列第86位。但其逆袭之势，还略低于2015年的黑马——东南大学附属中大医院，后者从2014年的第89位连跳36位，而今年更是持续跃升，由53位上升至47位。
持续跃升的背后，在中大医院院长滕皋军看来，与该院高峰学科崛起密不可分，尤其是该院重症医学科自去年首次进榜到今年，均居全国第二。同样，持续高歌猛进的还有青岛大学附属医院，该院在2016年的榜单中位列第75位，实现两年提升13位的骄人成绩。
温州医科大学附属眼视光医院（浙江省眼科医院）也有抢眼表现，自2016年首次上榜位列第96名，今年再次升至第88名。此外，河南省人民医院实现首次入榜，位列第97名。
只有更佳 没有最佳
自今年起，复旦版医院排行榜不再以“最佳”为医院和专科排名名称。
在复旦版医院排行榜创始人、复旦大学医院管理研究所所长高解春看来，虽然全国医院排行榜众多，但因维度和方法不同，意义也不同，都具备参考价值，应允许各类排行榜共存。排行榜优劣与否，应由各阶层大众去选择、评判，这才是真正的百家争鸣。就此意义而言，“只有更佳，没有最佳”。
今年榜单的评选原则和方法与往年相同，不同的是评审专家数据库再创新高，由2016年的3960名增加到4173名。今年，有2657名专家综合考虑每家医院的学科建设、临床技术与医疗质量、科研水平等关键因素后，投出自己的“庄严一票”，有效回复率较2016年的62.88 %上升到 63.67%，这一数据也远高于已有28年历史、早就进入“排行榜常态化”的美国最佳医院评选（33.5%）。
