按照行动方案要求，厦门市将以创建首批国家食品安全城市活动为载体，围绕畜牧业产品、种植业产品、水产品、饮用水、加工食品和餐饮业“五类产品、一个行业”的主要食品，从生产、流通、消费各环节入手，逐步完善包括食品生产加工体系、食品安全市场流通体系、食品安全监管体系、食品安全标准认证体系、食品安全风险防控体系、食品安全应急处置体系、食品安全信用体系、食品安全宣传教育体系、食品安全社会共治体系、食品安全信息体系等十大体系建设。
《方案》还提出，厦门的批发环节和商场、超市、连锁经营便利店、专卖店的预包装食品全面建立电子台账管理制度，逐步实现预包装食品的可追溯和可召回；整合现有各个食品安全追溯系统，建立统一高效的食品溯源体系。到2016年底，本地产蔬菜、水果质量安全监测合格率达95%以上；本地产畜禽产品质量安全监测合格率达99%以上；茶叶质量安全监测合格率达97%以上；水产品质量安全监测合格率达95%以上；成品粮、食用油、调味品、肉制品、蛋制品、酒类、乳制品、腐竹等质量安全抽查合格率达97%以上；瓶（桶）装水质量安全抽查合格率达91%以上。
