卵巢癌是一种致命的疾病,是出了名的难诊断治疗的癌症。加州大学圣地亚哥医学院以及Moores癌症中心科学家鉴定出了卵巢癌细胞的6个mRNA亚基(信使RNA),使早期卵巢癌的诊断成为可能。更重要的是,在这些mRNA亚基中,有些能编码针对新疗法的特殊蛋白质。这项研究成果5月25日发表在Proceedings of the National Academy of Sciences上。
“过去很多研究旨在利用DNA检测癌症”,该研究的第一作者(加州大学圣地亚哥遗传组医学院信息生物学专家以及项目科学家) Christian Barrett博士说,“我们很好奇,如果我们开发一种基于肿瘤特异性mRNA的卵巢癌检测方法来代替DNA检测的方法,会是怎样的结果?这种肿瘤特异性mRNA从肿瘤细胞扩散到子宫颈,且可以通过常规的巴氏试验收集”。
DNA与mRNA有什么联系和区别呢?DNA携带了生命所必须的所有指令,它包含的不仅仅是编译蛋白质的序列,还包含其他序列。而mRNA是DNA的互补序列,携带了蛋白质的所有信息。细胞核的DNA把遗传物质传递给mRNA,由mRNA转移都细胞质,在细胞质中各种细胞器可以识别mRNA中的信息,同时合成蛋白质。作者表明,利用肿瘤mRNA来诊断癌症优于DNA检测癌症的理由如下:一个癌症细胞可能只有一个或几个拷贝的DNA突变区,但可能有数百到数千拷贝的mRNA突变区。
为了确定是否可以通过mRNA从正常细胞中区分出卵巢癌细胞,研究人员开发了一个特定的生物信息学算法,并利用这个算法来挖掘两个公共遗传信息数据库——癌症基因图谱(TCGA)和基因组织表达程序(GTEx),这两个数据库都是由美国国立卫生研究所发起。TCGA编目了500个肿瘤的DNA和RNA,涵盖了许多种癌症类型,而GTEx是正常组织样本的DNA和RNA的数据库。基于此,研究人员可以分析295个卵巢肿瘤以及1839个正常组织样本的mRNA序列。
利用生物信息学的方法,研究人员确定了6种mRNA亚基分子,这些肿瘤特异性mRNA亚基的鉴定,对卵巢癌的早期诊断治疗有很大的帮助。同时他们用定量RT-PCR来验证其研究结果,用该技术来检测实验室培养的细胞中的卵巢癌mRNA分子。
除了在诊断方面的潜力,本研究中发现的mRNA亚基分子中个,有些还可以作为新的治疗靶点。科学家预测这些mRNA亚基可以翻译一些含有特殊氨基酸的蛋白质,这可使之成为一些特殊疗法的靶点,比如单克隆抗体、基于T细胞的疫苗等。更重要的是,卵巢癌特异性mRNA亚基本身就可以作为新的治疗靶点。
“我们是在实验室里研究一系列卵巢癌细胞得出的该结果,我们需要进行临床试验才能确定患有卵巢癌的妇女身上含有这种mRNA亚基分子,而未患卵巢癌的妇女身上没有这种mRNA亚基分子。”本研究的共同作者Cheryl Saenz医学博士(专门从事妇科癌症治疗的生殖医学临床专家)说,
本研究的作者承认他们的方法存在一些不足之处,其中包括mRNA亚基分子检测技术的不足,缺乏正常卵巢与输卵管的对照样本,肿瘤细胞向子宫颈扩散后基因表达可能与原始肿瘤不同。
不过,基于这些可喜的初步结果,作者建议将他们识别肿瘤特异性mRNA亚基的方法扩大到研究其他30个已知足够多RNA序列的癌症类型中。这6种mRNA亚型的发现将会有效的帮助广大女性进行早期的卵巢癌排查和诊断。同时也给卵巢癌治疗带来了新的方案。