“调整转型、创新再造”，坚持在改革创新中“谋发展、促转型”一直是南京医药近十年来的经营信条，每次改革创新都给南京医药带来跨越式的突破。
据了解，南京医药是一家立足于华东地区的医药流通企业，1996年国内上市。在国家医药产业政策调控不断深化、行业竞争不断加剧的环境下，在医药行业从垄断专营走向完全竞争的发展过程中，仅用了十年时间，南京医药就从一个年销售额仅十多亿、市属医药流通企业成为销售近两百亿、跨行业、跨区域的综合性集团化企业，企业的资产规模、业务规模、经营范围、企业价值等都得到大幅提升，连续九年居全国同行业前五位，连续四年被中国国务院经研中心、中国企业联合会评为中国500强企业。
在南京医药实现跨越式发展的这十年内，其掌门人周耀平深知市场的竞争是残酷的，同时机遇和挑战也是并存的，但机遇总是留给有准备的人。因此，以周耀平为董事长的南药董事会始终未雨绸缪，强调创新与整合是迎接市场竞争，推动企业跨越式发展的重要力量，“南京医药要有前瞻性地坚定做大做强的信念，整合并购是我们要走的路”。
据可查年报显示，南京医药从2002年开始启动收购兼并，截至2011年底合并企业123家，企业业务规模从2001年14.29亿元增至2011年171.72亿元。十年期间业务规模增幅1201%；年均增长率达30%，远超行业增长平均水平；2010年末的收入净资产比率高达15.34倍，远高于同行业水平。公司扩展步伐加快的同时，被收购企业的业务增长也非常快速，目前，南京医药的子公司中，销售过亿的企业有18家，南京医药从一个地方性企业成长为医药行业的全国性集团化企业，与上药、国药一起稳居全国前五位行列。
从2002年开始，南京医药在苏皖等地部分小规模医院开展药房托管试点。2006年，该模式试点工作在南京市委市政府推动下取得重大突破，改革预期“防腐、惠民、增效”目标初步实现，对医改起到借鉴作用。2008年以来，公司研究国外药事服务经历并吸收国际成功企业经验，详细调研并与三甲医院尝试药事服务战略合作，引进国外先进设备，借助信息化技术，取得地方政府政策支持，以集成化供应链“开放、柔性、兼容”管理思想为基础，全面探索基于利益协同的药事服务管理模式。南京医药的药事服务模式得到业界认可和追随，国家商务部也肯定了公司的商业模式并指出：“供应链管理是医药流通行业未来的发展方向”。目前，全国与南京医药开展药事服务合作的医院达270多家。
南京医药不断总结自身的探索实践，并提升优化。据了解，该企业的《医药流通企业基于供应链利益协同的药事服务管理》项目在获得江苏省和南京市“企业管理现代化创新成果”一等奖基础上，2011年3月，在全国企业管理创新大会上又获第十七届“全国企业管理现代化创新成果”一等奖。这是建国以来医药流通行业获得的最高级别国家奖项，也是江苏省企业首次获此殊荣。2012年6月，公司还荣获“江苏省管理创新优秀企业”称号。2013年1月，南京医药基于SaaS模式的物流软件服务平台研究与应用还获得了教育部颁发的科学技术进步二等奖。
十年耕耘、十年收获。过去十年，南京医药取得了跨越式发展，未来十年，南京医药将按照国家关于深化医药卫生体制改革的总体要求，根据建立健全基于国家基本药物制度的药品供应保障体系要求，通过管理模式创新和技术创新，依托集成化供应链模式的打造，特别是与医疗机构药事管理服务战略合作，来带动产业结构的优化升级，带动行业透明化、标准化和公平化，为未来的医药分开奠定坚实基础。
