研究发现针对靶标的miRNA降解（TDMD）需要ZSWIM8 Cullin-RING E3泛素连接酶。
导言
MicroRNA（miRNA）与Argonaute（AGO）蛋白相关联，以指导广泛的转录后基因抑制。尽管与AGO的结合通常可保护miRNA免受核酸酶的影响，但与某些非常规靶RNA的广泛配对可触发miRNA降解。
2020年11月12日，David P. Bartel团队在Science 在线发表题为“The ZSWIM8 ubiquitin ligase mediates target-directed microRNA degradation”的研究论文，该研究发现针对靶标的miRNA降解（TDMD）需要ZSWIM8 Cullin-RING E3泛素连接酶。
这一发现和其他发现提示并支持了TDMD的机理模型，在该模型中，通过泛素蛋白-蛋白酶体途径进行的AGO靶标蛋白水解暴露了miRNA的降解。 此外，功能丧失研究表明ZSWIM8 Cullin-RING连接酶可加速哺乳动物，果蝇和线虫细胞中多种miRNA的降解，从而确定了大多数短寿命miRNA的半衰期。 这些结果阐明了TDMD的机制，并扩展了其在塑造动物中miRNA水平方面的研究的推动作用。
微小RNA（miRNA）是与mRNA中的位点配对的22个核苷酸（nt）RNA，这会导致这些mRNA靶标更快地降解和/或翻译抑制。总体而言，miRNA调节大多数人类mRNA，而在哺乳动物中发现的90个广泛保存的miRNA家族中，大多数是生存力或正常发育所必需的。与通常仅在几个小时后衰变的mRNA相比，大多数miRNA的持久时间要长得多，通常长于一天，有时长于一周。这种稳定性可以通过将每个miRNA留在效应蛋白Argonaute（AGO）中来解释，该蛋白在其整个长度上都与miRNA相互作用，从而保护其免受核酸酶的破坏。
尽管大多数miRNA都具有稳定性，但有些miRNA的寿命相对较短，半衰期在<2小时至10小时之间。miRNA与异常高度互补的靶标之间的配对会触发miRNA的衰变，从而颠倒典型的调节逻辑。这种现象称为靶标导向的miRNA降解（TDMD），最初是在将反义miRNA抑制剂或具有广泛配对的人工靶标引入细胞后，或在被某些疱疹病毒感染后表达的，这些疱疹病毒表达具有广泛配对位点的转录本指导宿主抗病毒miRNA降解。
最近，还发现了四个细胞转录物可触发TDMD。例如，Cyrano长非编码RNA（lncRNA）指导miR-7 miRNA的有效降解。删除Cyrano或突变Cyrano中与miR-7广泛配对的位点后，稳态miR-7水平在某些细胞和组织中增加了多达50倍。而且，在失去Cyrano后，miR-7的半衰期增加，与大多数其他miRNA相似。
与触发TDMD的广泛配对位点相反，大多数miRNA调控位点仅与miRNA种子区域（来自miRNA 5'末端的2-8个核苷酸）配对。一些位点还具有补充配对，但是这种配对不太常见（仅在5％的优先保守位点中保守），并且很少接近miRNA 3'末端，这解释了为什么大多数调节位点都不会触发TDMD。对TDMD机制的更好理解将受益于这种现象所需的蛋白质的鉴定。尽管TDMD于十多年前首次被描述，但尚无此类蛋白的报道。
该研究发现针对靶标的miRNA降解（TDMD）需要ZSWIM8 Cullin-RING E3泛素连接酶。这一发现和其他发现提示并支持了TDMD的机理模型，在该模型中，通过泛素蛋白-蛋白酶体途径进行的AGO靶标蛋白水解暴露了miRNA的降解。此外，功能丧失研究表明ZSWIM8 Cullin-RING连接酶可加速哺乳动物，果蝇和线虫细胞中多种miRNA的降解，从而确定了大多数短寿命miRNA的半衰期。这些结果阐明了TDMD的机制，并扩展了其在塑造动物中miRNA水平方面的研究的推动作用。（iNature）
参考资料：
[1] The ZSWIM8 ubiquitin ligase mediates target-directed microRNA degradation
