近日,一组研究人员开发出一种能查明癌症的基因“驱动程序”的新综合方法,新研究揭示了可能是治疗乳腺癌的八个可行靶标基因。
这项研究发表在Nature Genetics杂志上。研究人员研究了多种致癌途径,涉及正常细胞转变成癌细胞过程中的基因变异,其中包括控制癌细胞生长率的基因途径。细胞的高生长速率也被称为细胞增殖,被认为与乳癌患者不良预后有关。
在这里,研究提出了一种基于致癌途径活性的基因表达签名使用完整的基因组策略(N = 52)作为一个框架来分析和全基因组RNA干扰屏幕数据相结合,介导DNA拷贝数的变化。确定特定的DNA扩增和重要基因的扩增产物在这些关键基因的司机表示,包括已知的和新的监管机构发生。
研究人员确定必不可少的关于细胞的增殖八对的基因(fgd5,mettl6,CPT1A,成DTX3,mrps23,eif2s2,eIF6和SLC2A10)是唯一的扩增患者高度增生管腔乳腺肿瘤,临床病人的一些治疗方案是有效的。这是一般的策略已通过基因组数据集的一种综合运用确定治疗目标,在扩增子的潜力。
使用这种新的计算方法,我们能够利用现有丰富数据资源,确定针对乳腺癌患者特定子集的若干新的潜在药物靶标。
事实上,所鉴定出的8个基因中的基因CPT1A已经是淋巴瘤药物治疗靶标,并很有可能被用于乳腺癌患者治疗。靶向CPT1A药物在体外、淋巴瘤的小鼠模型中已被证明能抑制人类肿瘤细胞系生长。
利用多种数据类型的全面和综合分析,包括基因表达数据,体细胞突变,DNA拷贝数以及功能基因组学数据集,能更好地了解癌症的驱动基因。(药品资讯网信息中心)